También goza de raigambre el fútbol sala, siendo la región hogar del Inter FS (que ha jugado en Madrid, Alcobendas, Alcalá de Henares y actualmente en Torrejón de Ardoz), el club más laureado del mundo en este deporte, y del Futsi Atlético de Madrid Navalcarnero, varias veces campeón de Europa en la modalidad femenina. Consiguió ser el primer campeón Invicto de la Primera B Nacional. El primer partido se impuso Argentino por 2 a 1 y en el segundo partido igualaron en uno, lo que dio un global de 3 a dos a favor de Atlético Argentino.
