Saúl comenzó a despuntar desde muy pequeño y el Real Madrid le fichó para su equipo alevín, aunque dos temporadas más tarde, cuando contaba 14 años, firmó por el cadete del Atlético. Nacido en el seno de una familia vinculada al mundo del fútbol, Saúl es hijo de José Antonio Ñíguez «Boria», delantero que llegó a jugar con el Elche en Primera división, y hermano de Jony y Aarón, futbolistas que militan actualmente en las filas del Guadalajara y Almería, respectivamente, camiseta atletico de madrid en la Liga Adelante.